重慶直轄市氣象局組建于1997年10月，12月27日正式掛牌。直接管理34個(gè)區(qū)縣氣象局（站），截止2009年12月，全市氣象職工總數(shù)1213人，其中在職職工758人，離退休職工455人。全市氣象部門(mén)目前有正研級(jí)高級(jí)工程師5人，副研級(jí)高級(jí)工程師70人，工程師355人。
重慶市氣象局設(shè)立了辦公室、應(yīng)急與減災(zāi)處、觀測(cè)與網(wǎng)絡(luò)處、科技與預(yù)報(bào)處（氣候變化處）、計(jì)劃財(cái)務(wù)處、人事處、政策法規(guī)處、監(jiān)察審計(jì)處（與黨組紀(jì)檢組合署辦公）8個(gè)職能處（室）和機(jī)關(guān)黨委辦公室（精神文明建設(shè)辦公室）、離退休干部辦公室；建立了氣象臺(tái)、氣候中心、氣象信息與技術(shù)保障中心、后勤服務(wù)中心、科研所、結(jié)算中心、氣象影視中心、氣象科技中心８?jìng)€(gè)直屬單位；人工影響天氣辦公室、防雷中心2個(gè)地方氣象事業(yè)機(jī)構(gòu)以及社團(tuán)組織重慶市氣象學(xué)會(huì)。
